El Pro Micro  cuenta con el microcontrolador del Arduino Leonardo y sus mejoras: entre ellas 0,5KiB más de memoria SRAM, llegando ahora a un total de 2,5KiB, y soporte para USB nativo por lo que ahora en el mismo espacio también se cuenta con un conector MicroUSB evitando así la necesidad de un programador externo, sin olvidar que el USB nativo nos permite que el Arduino se comporte como un teclado, ratón o gamepad con el ordenador.
Cuenta con 18 salidas/entradas digitales de las cuales 5 tienen función PWM, 9 funcionan también como entradas analógicas, 2 como puerto UART, 2 más para el puerto I2C, y 3 para el puerto ISP.